大型通過式拋丸機的整機采用手自一體化操作作業。拋丸機控制臺上設有單獨控制器，可分步控制設備，拋丸機控制臺上設有急停開關，在特殊情況下可控制該通過式拋丸機設備停機。大型通過式拋丸機的拋丸室檢修門、提升機檢修門等重要位置均設有安全聯鎖開關裝置。

通過式拋丸機的控制系統由氣控制系統和電氣系統兩部分組成，氣控系統由氣源處理元件和氣閥以及氣動執行元件組成，為保證設備的可靠性，江蘇拋丸機廠家均采用了國內外知名品牌的產品。

整套系統手動操作，拋丸機設備各部件按序進行順序操作；便于調試、檢修人員對設備進行調整，此時操作人員可安順序依次啟動各功能部件，也可單獨運行各部件，已測試各相關部件的性能、運行情況等。為了保證正常安全運行，設備裝有報警裝置，若在生產過程中發現某一運行部位出現故障，就會立即報警，停止全線運行，并在控制臺上顯示故障發生點。
拋丸機的電氣系統具有以下特點：

• 1、檢修門與拋丸器互鎖，檢修門打開，拋丸器不能工作；
• 2、設有彈丸循環系統故障報警功能，并且該系統之任一部件出現故障，其在拋丸機上面的部件自動停止運行，以防彈丸卡死并燒毀動力裝置；
• 3、通過式拋丸機各道工序間具有連鎖保護功能；
• 4、系統具有防止誤操作設有急停車按鈕。